2024年11月21日 星期四

第一例与GYPB(P2)等位基因无关的c.137-8C>T GYPB突变案例报道

时间:2024-10-22来源:浙江省血液中心作者:翻译:郑维维 浙江大学医学院附属邵逸夫医院 审核专家:王拥军

MNS基因复合物(GYP)位于4号染色体(4q31.21)的长臂上,由三个紧密相连的基因组成:GYPA编码携带M和N抗原的血型糖蛋白A,GYPB编码携带S、s和U抗原的血型糖蛋白B,以及没有MNS抗原特异性的GYPE。文献中报道了GYPA和GPYB中的几十种单核苷酸多态性(SNP),在MNS系统中产生变异抗原。GYPB基因的两个等位基因P2和NY产生S-,s-,Uvar表型。迄今为止分析的所有GYPB(P2)和GYPB(NY)等位基因都携带GYPBS特异性SNP。2013年,Arnaud等人描述了使用BioArray HEA v1.2BeadChiprm试剂盒 (Werfen,意大利米兰)检测到的一种干扰GYPBS等位基因分型的GYPB突变。他们通过该试剂盒对两名患者进行基因分型,发现他们为GYPB(P2)杂合子和GYPBs纯合子,进而在患者的DNA中鉴定出一种新的c.137-8C>T突变,该突变与P2等位基因相关。

我们的扩展血清学分型研究使用Grifols(西班牙巴塞罗那)公司提供的全自动凝胶检测方法(DG Gel),对ABO、C、E、c、eK、kpa、Kpb、Fya、Fyb、Jka、jkb、M、N、S、s、Lua、Lub、Pi、Xga、Lea、Leb表型进行分析。对于基因分型,我们采用了Werfen公司提供的基于微阵列的BioArray HEA v1.2 BeadChip 试剂盒,该试剂盒涉及C、E、c、e、V、VS、K、k、Kpa、Kpb、JsaJsb、Fya、Fyb、Fyb-weak、Fy-null、Jka、kb、M、N、S、s、U-var、U-neg、Lua、Lub、Dia、DibDoa、Dob、Hy、Joa、Coa、Cob、Scl、Sc2、LWa、LWb多种表型的检测。该试剂盒检测的UvarP2和NY等位基因分别由针对c.270+5G>T和c.230C>T的特异性探针检测。

本案例的患者是MS,38岁高加索男性,其红细胞表型为CCDEE kk,由于是RhCE单倍型,我们进一步进行扩展血清分型和基因分型分析。扩展分型的结果显示为Fya+b+,Jka+b+,Kpa-b+,Lea-b+,Lua-b+,M+N+S+s+,Pi+。S抗原呈阳性,但反应性中等(+---)。基于基因分型预测的表型为C-c+,E+e-,K-kt,Kpa-b+,Jsa-b+,Fya+b+,Jka+b+,M+,N+,S(未确定),s,U+,Lua-b+,Dia-b+,Coa+b-,Doa+b-,Hy,Joat,IWa+b-,Sc1+2-。为了更好地定义GYPB*S等位基因,从供体MS提取的基因组DNA样本被送往参考实验室进行双向DNA测序。如图1所示,基因组测序确认了GYP*S和GYPB*s等位基因的存在,从而预测出S+s+表型。然而,还观察到一个杂合的c.137-8C>T点突变。该多态性在数据库中记录为rs183176514,位于HEA BeadChiprm试剂盒探针结合区域,并影响S抗原的检测,导致我们分子分析中反复出现不确定的结果。测序分析和HEA BeadChiprm结果(图1A,橙色箭头)均未显示GYPB(P2)等位基因的特征突变,c.270+5G/T。已知c.137-8C>T GYPB突变会影响BioArray HEA vi.2 BeadChip试剂盒对S抗原(GYPB C.143T)的检测,导致结果的不确定。之前的报告中,这种突变均与GYPB(P2)等位基因特征性的c.270+5G/T多态性相关。据我们所知,这是首次描述这种基因改变与P2等位基因无关的案例。根据我们的血清学数据,当S抗原与其他GYPB多态性无关时,突变会导致S抗原的弱表达。

Figure 1 基因型结果
(A)显示了使用 Werfen BioArray HEA v1.2 BeadChip 试剂盒进行的基因分型,箭头表示序列中没有GYPB(P2) 等位基因 

(B和C)红色:脱氨酸(A),蓝色:胞嘧啶(C),黄色:鸟嘌呤(G),绿色:胸腺嘧啶(T)绿色和蓝色:嘧啶(Y)